3)Deoxyinosine linker : 5’-말단과 3’-말단을 구조적, 기능적으로 연결하는 조절 부위
2. DLP의 특징
DLP는 PCR 조건을 최적화 하기 위해 소요되는 시간과 노력을 줄여주며, Primer 길이, GC content, annealing 온도, sequence(hairpin, self or cross dimer로 인한 2차 구조)와 같은 primer design 시 고려해야할 조건에 일반 primer보다 자유롭게 디자인할 수 있게 해줍니다.
A. 일반적인 Primer 구조
B. DPL 프라이머 구조
Conventional primer 는 높은 특정 annealing 온도에서만 특이성을 나타내고, anealing 온도가 낮아지면 non-specific band와 같은 false product 가 생성됩니다. (lanes 1 and 2)
1. DLP는 여러가지 annealing 온도조건에서도 높은 특이성을 나타냅니다.
DLPTM primer는 anealing 온도가 변하더라도 정확한 Target 유전자 만을 증폭할 수 있습니다.(Lane 3 and 4) Lane 1, 2 : Conventional Primer Lane 3, 4 : DLPTM Primer Lane 1, 3 : Negative control Lane 2, 4 : Positive control
2. GC 함량 (%)이 높은 조건에서도 target sequence만 정확하게 증폭합니다.
Conventional primer를 사용한 multiplex PCR에서는 primer간의 competition, dimer 형성, 서로 다른 anealing 온도로 인해 타겟을 정확하게 증폭할 수 없습니다. (Lane2, 4)
DLPTM를 사용한 multiplex PCR에서는 dual priming 으로 인해 primer 간의 dimer 및 hairpin 형성이 억제 됨으로써 specific target band만 정확하게 증폭됩니다. (Lane 1, 3)
3. 다양한 분자진단 분야 적용이 가능합니다.
Multiple pathogen detection : 한번에 다양한 원인균 및 바이러스를 동시에 검사
Multiple genotyping : 다양한 병원체의 유전자형 (genotyping), 아형 (subtype) 선별검사
Multiple SNP mutation detection : 약제 내성, 유전자질환 돌연변이 검사, 암 진단 검사